3D skriva ut ett Protein: modellering en molekylär maskin (4 / 6 steg)

Steg 4: Protein yta

1. Öppna PyMOL. har du menyraden och betraktaren öppen.
2. Gå till Arkivera > öppen på menyraden. Se till att ha PyMOL söker efter alla tillägg. Öppna filen molekyl som du hämtade tidigare.
3. Du kommer se din molekyl öppna här i visningsprogrammet på denna punkt! Jag rekommenderar dig att spela runt med alla de vyer och funktioner du har tillgängliga för dig. Detta är spännande skärningspunkten mellan kemi, biologi och teknik till ditt förfogande.
4. Några användbara kommandon: vänster musknapp roterar, mellersta musknapp flyttar molekylen, höger musknapp knappen flyttar upp och ner i dimensionen z. (Mer information om grundläggande kommandon är beläget här och en fuska ark ligger
   
   
   , med tillstånd av PyMOL Wiki)

   (Kul att notera: om du kolla Display > Stereo och ändra Display > Stereo > stereoläge kan du aktivera 3D visning höger på skärmen med hjälp av Cross-Eye Vision eller röd-blå Anaglyf Vision !)

5. För att göra din molekyl som en yta, gå till rutan "S" (Show) till höger om ditt protein namn, klicka, sedan muspekaren över som. Därifrån kan du klicka på alternativet yta.
6. Härifrån kan du ändra hur din yta genererades, hur det var visas eller det har färg med hjälp av den inställningen > ytan menyn.
7. När du är nöjd med din yta, bege dig till Fil > Spara bild som > VRML2. Detta kommer att spara bilden som en .wrl fil, del av VRML-format (Virtual Reality Modeling Language).

Vid denna punkt, kanske du redan vid den punkt där du kan skicka din modell till en plats som skulle skriva ut det! i.Materialise och Shapeways stöder både .wrl filer. Du kan behöva skala modellen ner eller upp, eller rotera den, beroende på dina utskriftsbehov och önskemål. Du kan också vilja port din nya molekylära filen till en. stl filen, en av de vanligaste 3D modellering/utskrift format tillgängliga, och en Makerbot använder. Jag ska gå in i myriaden av 3D manipulation program tillgängliga, och täcker de grundläggande funktionerna som du måste utföra för att få din fil Makerbot .stl redo.