Ember skrivare: Hur en Voxel växer (3 / 4 steg)
Steg 3: Fotografera voxlar
Voxel serien bör vara fotograferade med Mikroskop vid tillräcklig förstoring att tydligt visa den växande voxlar, men tillräckligt låg för att visa flera steg i varje bild, med tillräckligt överlappning mellan på varandra följande bilder att identifiera var i serien var och en börjar och slutar.
Om det behövs kan bilderna rätas med Photoshop, GIMP eller andra bildbehandlingsprogram. Använd sedan GraphClick för att digitalisera hörnen vid basen av varje sprocket, börjar med den högra sidan av det första drevet, som visas ovan. Exportera de uppmätta koordinaterna till en textfil, med samma grundläggande namn som image-filen.
Bilder och samordna filer sedan körs genom den bifogade Processing skissen (extractFrames.pde) genom att placera dem i undermappen "input". Det utdrag bilder av den växande voxel mellan sprocket koordinaterna och sparar i undermappen "utgång". Jag har också bifogat min ingång micrographs och associerade samordna filer och filmbildrutor skapad från dem av skissen.
Förmodligen måste du justera bredd, höjd och förskjutning variablerna för att rymma upplösningen på din egen micrographs. Bredden bör vara tillräckligt smal för att utesluta kedjehjul, och både bredd och höjd bör vara tillräckligt stor för att innehålla en helt exponerade voxel plus några bas lager de växer från. Offset anger hur mycket av denna bas visas. Ram måtten jag använde illustreras med en röd rektangel på bilden ovan.
Finns också tre representativa ramar i full storlek, med grå och effektiv exponeringstider som nämnts ovan.